Los "tissue microarrays pronósticos" contienen muestras de tejidos de pacientes cuyo seguimiento está disponible, como los datos de recurrencia del tumor, respuesta al tratamiento, supervivencia libre de progresión y supervivncia global. Este tipo de tissue microarrays necesitan un análisis muy detallado y cuidadoso para dar valor a unas características clínicas de agresividad tumoral.

El estudio con tissue microarrays ha confirmado el valor pronóstico de ciertos marcadores moleculares (receptor estrogénico, receptor de progesterona, HER2,...) que habían sido estudiados con otras técnicas. Más aún, el análisis con tissue microarrays ha revelado una similar o incluso mayor asociación de determinadas marcadores con el pronóstico de ciertos tumores. Aunque estos resultados pueden variar dependiendo del tipo de tumor o del marcador biológico determinado, los datos actuales sugieren que el estudio con tissue microarrays será el más adecuado para el "screening" de la asociación de marcadores moleculares con objetivos clínicos.